卵巢囊肿手术后通常是不会影响怀孕的 。对于生育年龄的患者,如果卵巢局部有囊肿就需要进行手术治疗,多数是将单纯的囊肿剔除,保留卵巢的组织。卵巢组织在手术后可以恢复正常的功能,可以有卵泡生长发育,所以患者不会影响到怀孕。如果患者是卵巢巧克力囊肿,则有可能就会影响怀孕。因为卵巢巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种,手术后可能就会复发。