自然流产孕囊一般会自己排出 。自然流产是指孕囊组织已经自行完全或者不全排出来了,如果已经明确检查到胚胎不发育,一般不可以持续等到自然流产的发生。因为不发育的胚胎组织有可能会进入母体内,变成促凝物质,从而导致大量出血。所以出现自然流产时需要尽早地接受干预,尽早地排空子宫。