自然流产的胚胎不需要埋掉 。如果采用的是药物流产,阴道排出的分泌物有血块状物质,应该是孕囊。如果在家中,需保留阴道排出物,去医院请专业医生看是否排除的是妊娠物,再将流出来的胚胎按照医疗垃圾处理办法,由有关医院部门处理。如果是医院做人工流产,清宫手术完毕以后。医生检查胚胎是否干净,再进行处理。流产下来的孕囊可以埋了,医院也会做处理。