复方血栓通胶囊的副作用尚不明确，但部分患者在用药后可能会出现胃肠道不适、过敏反应、血压降低、头晕、心悸等副作用。复方血栓通胶囊是一种中成药，主要成分有三七、黄芪、丹参等，具有扩张血管、改善微循环、增加脑血流量、降低血液黏稠度、抑制血小板聚集等作用，可以用于治疗视网膜静脉阻塞、脑动脉硬化、心绞痛等病症。
1、胃肠道不适
复方血栓通胶囊具有一定的刺激性，部分患者服用后可能会刺激胃肠道，引起恶心、腹胀、腹痛等不适症状。
2、过敏反应
如果患者对复方血栓通胶囊中的药物成分过敏，服用后可能会引起过敏反应，出现皮疹、瘙痒等不适症状。
3、血压降低
复方血栓通胶囊具有扩张血管的作用，部分患者服用后可能会导致血压下降，出现头晕、乏力等症状。
4、头晕
复方血栓通胶囊具有活血化瘀的作用，部分患者服用后可能会导致脑部供血不足，从而引起头晕的症状。建议患者及时停止服用复方血栓通胶囊，以免加重不适症状。
5、心悸
复方血栓通胶囊具有活血化瘀的作用，部分患者服用后可能会加重心脏负担，从而引起心悸的症状。建议患者在医生指导下服用，避免盲目用药。
另外，建议在医生指导下服用药物，不可自行盲目用药，以免引起不良反应，对身体造成损伤。如果患者服用复方血栓通胶囊后出现不适症状，建议及时就医治疗。