指甲下面长肉芽碰到会疼可能是指甲修剪不当、甲沟炎、甲癣等原因导致的，需要根据病因选择针对性的治疗措施。
1、指甲修剪不当
如果指甲修剪过度，可能会刺激到周围的皮肤，容易出现长肉芽的情况。需要注意指甲的修剪，以免病情持续发展。
2、甲沟炎
指甲修剪过深、长期接触刺激性的物质等，可能会导致局部受到细菌等致病菌的入侵，容易引发炎症反应，通常会伴随红肿、疼痛等症状。可以遵医嘱使用红霉素软膏、夫西地酸乳膏等药物进行治疗。
3、甲癣
甲癣通常跟真菌感染有关，会导致指甲的颜色发黄、增厚等，甚至会伴随疼痛的症状。可以遵医嘱使用伊曲康唑胶囊、盐酸特比萘芬乳膏等药物进行治疗。
除此之外，还有可能与湿疹、接触性皮炎等原因有关，应及时就医治疗。
