涂疣清宁后很痛一般是不正常的，可能是药物的不良反应、用药不当、疣体残留、过敏反应、继发感染等原因引起的。
1、药物的不良反应
疣清宁是一种外用药物，具有腐蚀性，通常用于治疗尖锐湿疣、扁平疣等疾病。患者在使用疣清宁时，可能会对局部皮肤造成一定的刺激，从而出现局部红肿、疼痛等不良反应，这一般是不正常的。患者可以使用清水清洗患处，缓解疼痛症状，也可以在医生的指导下更换其他药物进行治疗。
2、用药不当
疣清宁是一种治疗疣的药物，如果患者没有遵医嘱使用，可能会导致药物使用不当，从而出现上述症状。建议患者及时就医，需要在医生指导下进行用药治疗，不可以自行盲目用药。
3、疣体残留
如果患者在使用疣清宁的过程中，没有将疣体清除干净，可能会导致疣体残留，从而引起涂抹药物后出现疼痛的症状。建议患者及时就医，需要在医生指导下使用专业的医疗器械将疣体进行清除。
4、过敏反应
如果患者对疣清宁过敏，在涂抹疣清宁后，可能会引起过敏反应，出现局部红肿、瘙痒、疼痛等不适症状。建议患者及时停止使用疣清宁，并在医生指导下使用氯雷他定、盐酸西替利嗪等抗组胺药物进行治疗。
5、继发感染
如果在治疗期间，患者不注意局部卫生，可能会导致局部继发细菌感染，从而引起疼痛、红肿等不适症状。患者可以遵医嘱使用红霉素软膏、莫匹罗星软膏等药物进行治疗。
在日常生活中，患者要注意个人卫生，保持患处皮肤清洁干燥，避免用手抓挠。患者也要注意清淡饮食，避免食用辛辣刺激的食物，以免加重病情。如果患者出现不适症状，建议及时就医治疗。