儿童喉咙有疱疹可以遵医嘱服用抗病毒药物、抗生素类药物、清热解毒的中成药、止痛药物以及雾化吸入药物等进行治疗。
1.抗病毒药物：如果儿童喉咙部位出现疱疹是由于病毒感染所引起的，可以在医生指导下服用阿昔洛韦片、利巴韦林颗粒等抗病毒药物进行治疗，能够起到抑制病毒复制的作用，从而促进病情恢复。
2.抗生素类药物：如果是细菌感染引起的，可遵医嘱口服头孢克肟胶囊、阿莫西林颗粒等抗生素类药物进行治疗，控制炎症反应。
3.清热解毒的中成药：如果儿童喉咙部位的疱疹比较小，并没有伴随其他不适症状，一般不需要特殊治疗。但如果出现了明显的疼痛感，则需要在医生指导下使用清热解毒的中成药进行治疗，比如蒲地蓝消炎口服液、金银花颗粒等，有利于疾病的恢复。
4.止痛药物：如果疼痛的症状相对严重，也可以遵医嘱服用布洛芬混悬液、对乙酰氨基酚颗粒等非甾体类抗炎药进行止痛治疗。
5.雾化吸入药物：如果喉咙部位的疱疹比较大，而且伴有咳嗽咳痰等症状，还可以通过雾化吸入的方式进行治疗，使用的药物主要包括生理盐水、布地奈德混悬液等，能够有效缓解咽喉部黏膜充血的情况，减轻给身体带来的损伤。
建议家长及时带患儿到医院就诊，在医生指导下选择合适的药物进行治疗。同时还要注意合理饮食，避免吃辛辣刺激性的食物，以免加重病情。