射精后睾丸、小腹疼痛的原因较多，可能是性生活过于频繁等生理性因素导致的，也可能是附睾炎、尿道炎、前列腺炎、输尿管结石等病理性因素导致。如果症状持续不缓解，建议及时就医进行检查和治疗。
1.性生活过于频繁：部分男性由于手淫或者性生活频率过多，可引起阴囊局部充血，在射精时可能刺激到患处，出现睾丸以及小腹部放射性疼痛的症状。此时需要减少同房次数，并注意休息，通常能够自行恢复。
2.附睾炎：多由细菌感染等因素导致，炎症因子会刺激附睾部位的神经末梢，引发射精后的睾丸、小腹疼痛不适。确诊以后需应用抗生素类药物进行抗感染治疗，如阿莫西林胶囊、左氧氟沙星片等。
3.尿道炎：若平时卫生习惯不佳或者是存在不洁性生活，容易诱发尿道炎，炎症反应也会对周围组织产生刺激，进而引起上述情况，还可伴有排尿疼痛、尿频等症状。对此应遵医嘱使用抗菌药物治疗，例如注射用头孢曲松钠、盐酸环丙沙星片等。
4.前列腺炎：可能与久坐、过度饮酒等因素有关，会导致前列腺局部肿大，从而压迫到附近的神经血管，引起下腹部及睾丸区域坠胀痛。患者可以遵医嘱选用前列舒通胶囊、癃闭舒片等药物进行治疗。
5.输尿管结石：可能继发于肾结石，当结石向下移动的过程中卡在输尿管狭窄的位置，则会引起明显的疼痛症状，类似于睾丸以及小腹位置的放射性疼痛。对于较小的结石一般可以通过多喝水促进排出，而对于较大的结石则应该考虑体外冲击波碎石术的方式进行处理。
此外，若是患有精索静脉曲张、睾丸肿瘤等疾病，也可能出现类似症状。日常生活中要注意个人卫生，勤换洗内裤，适当运动锻炼增强体质。