耳朵CT和耳朵磁共振的区别在于成像原理不同、侧重点不同、检查结果不同等，具体需要在医生指导下进行诊断。
1、成像原理不同
耳朵CT是利用X射线对患者的耳部进行扫描，从而了解耳部结构是否存在异常。耳朵磁共振是利用磁场进行扫描，从而了解耳部是否存在异常。
2、侧重点不同
耳朵CT对耳部结构的显示效果优于磁共振，可清楚地显示外耳道、鼓膜、中耳、内耳道及颞骨骨质的细小病变，对于耳部的细小病变，例如外耳道的狭窄、鼓膜穿孔、听骨链的破坏等显示效果优于磁共振。耳朵磁共振对耳部结构的显示效果优于CT，但对骨质的显示效果不如CT。
3、检查结果不同
耳朵CT可以显示外耳道的真实结构，有利于耳部疾病的早期发现和早期治疗。耳朵磁共振可以显示内耳道、听神经、半规管等结构，对内耳疾病的诊断有重要的辅助作用。
除此之外，价格也不同，对于患有严重外耳道疾病、急性中耳炎或者慢性中耳炎的患者，通常需要使用耳部CT检查。建议患者在日常生活中注意耳部护理，避免长期处于嘈杂的环境中，以免损害听力神经。若出现不适症状，建议患者及时就医治疗。
