目前并没有治疗藏毛窦的特效药物。如果患者出现不适症状，可以遵医嘱使用抗生素、止痛药等进行对症处理，必要时也可以采取手术方式进行治疗。
1.抗生素：若局部发生感染的情况，则需要在医生指导下服用阿莫西林胶囊、头孢克肟颗粒等药物进行抗感染治疗。
2.止痛药：当疼痛难忍时可配合医生服用布洛芬缓释片、双氯芬酸钠缓释片等非甾体类抗炎药物进行缓解。
3.糖皮质激素：对于继发细菌感染者还可遵医嘱静脉滴注注射用甲泼尼龙琥珀酸钠、醋酸地塞米松磷酸钠注射液等药物控制炎症反应。
4.清热解毒剂：如连翘败毒丸、二丁颗粒等，此类中成药具有较好的清热解毒作用，在一定程度上也可促进疾病恢复。
5.其他：部分中医认为该病与湿热有关，因此还可以遵医嘱口服黄连解毒汤、八正散等中药方剂进行调理。
需要注意的是，上述药物均需严格遵照医嘱服用，不可自行盲目用药。另外，若经积极规范治疗后，病情持续未见改善甚至呈加重趋势，还需及时就医诊治。