嘴巴上长痘痘很疼可能是痤疮、毛囊炎、皮脂腺囊肿、疖、单纯疱疹等原因导致的，患者需根据具体病因进行针对性治疗。
1、痤疮
痤疮是指毛囊皮脂腺发生炎症，可能会出现脓疱、丘疹、结节等症状。患者可以遵医嘱涂抹阿达帕林凝胶、维A酸乳膏等药物治疗，还可以通过红蓝光照射疗法治疗。
2、毛囊炎
毛囊炎是指毛囊发生的炎症反应，可能会出现红色丘疹、白色脓疱、疼痛等症状。患者可以遵医嘱涂抹莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等药物治疗，还可以通过远红外线照射疗法治疗。
3、皮脂腺囊肿
皮脂腺囊肿主要由于皮脂腺排泄管阻塞，皮脂腺囊状上皮被逐渐增多的内容物膨胀所形成的潴留性囊肿。患者可能会出现嘴巴上长痘痘、疼痛等症状。如果囊肿较小，可以在医生指导下使用头孢曲松钠、头孢唑肟钠等药物进行抗感染治疗。如果囊肿较大，可以通过手术切除的方式进行治疗。
4、疖
疖通常是指金黄色葡萄球菌等致病菌侵袭单个毛囊以及周围组织，导致局部出现急性化脓性炎症的情况。患者一般会表现为局部皮肤红肿、疼痛等症状。建议患者可以在医生指导下使用鱼石脂软膏、盐酸左氧氟沙星胶囊等药物进行治疗。必要时，患者也可以通过手术的方式进行治疗。
5、单纯疱疹
单纯疱疹是指由单纯疱疹病毒引起的感染性疾病，可能会导致嘴巴周围出现群集性水疱，并伴有疼痛症状。建议患者可以在医生指导下使用阿昔洛韦乳膏、喷昔洛韦乳膏等药物进行治疗。同时，患者也可以遵医嘱口服抗病毒口服液、板蓝根颗粒等中成药进行治疗。
在日常生活中，患者应注意个人卫生，保持皮肤干燥清洁，避免用手抓挠患处。如果出现不适症状时，建议患者及时就医治疗。