去疣药膏疼痛可能是药物刺激、用药不当、药物过敏、药物性皮炎、接触性皮炎等原因导致的，需要根据不同的原因选择针对性的治疗。
1、药物刺激
去疣的药膏中可能会含有刺激皮肤的成分，如果患者皮肤不耐受，可能会出现局部皮肤刺痛、红肿等不适症状。如果症状比较轻微，一般不需要特殊治疗，通常在一段时间后会自行缓解。如果症状比较严重，患者可以在医生的指导下更换其他药物进行治疗。
2、用药不当
如果患者在使用药物时，没有遵医嘱按照正确的用法用量使用，可能会使药物对局部皮肤造成刺激，从而出现皮肤红肿、刺痛等症状。建议患者及时就医，可以在医生指导下使用硫酸镁溶液湿敷局部皮肤进行改善。同时，患者也可以遵医嘱使用阿莫西林胶囊、头孢克肟胶囊等药物进行抗感染治疗。
3、药物过敏
如果患者属于过敏体质，可能会对去疣的药膏中的成分过敏，从而引起皮肤过敏反应，出现局部皮肤红肿、瘙痒、刺痛等症状。建议患者及时停止使用药物，并在医生的指导下服用氯雷他定片、盐酸西替利嗪片等药物进行抗过敏治疗。同时，患者也可以遵医嘱外用炉甘石洗剂、丁酸氢化可的松乳膏等药物缓解不适症状。
4、药物性皮炎
如果患者长期使用去疣的药膏，可能会导致皮肤受到刺激，从而引起药物性皮炎，出现局部皮肤红肿、刺痛等症状。建议患者可以在医生指导下使用醋酸泼尼松片、地塞米松片等药物进行抗炎治疗。同时，患者也可以遵医嘱使用氯雷他定片、盐酸西替利嗪片等药物进行抗过敏治疗。
5、接触性皮炎
接触性皮炎主要是由于接触皮肤外源性物质而引起的皮肤炎症性损害，通常与外界刺激、过敏反应、精神因素等因素有关。临床上一般会表现为局部皮肤红肿、瘙痒、疼痛等症状。建议患者可以在医生指导下使用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等涂抹患处进行治疗。必要时，患者也可以遵医嘱使用醋酸泼尼松片、甲泼尼龙片等药物进行治疗。
建议患者及时就医，查明具体病因后对症治疗，以免延误病情。