附睾囊肿术后一般不会影响性功能，因为附睾囊肿手术主要是将患侧附睾切除，而性功能主要是与睾丸有关，与附睾囊肿没有太大关系。
附睾是位于阴囊内的一对细长的器官，附睾囊肿是指在附睾的部位出现囊性病变，是一种良性疾病，一般是由于精液淤积、感染等原因所引起。如果患者在附睾囊肿术后，没有出现感染的情况，一般不会影响到性功能。但如果患者在附睾囊肿术后，出现感染的情况，则可能会影响到性功能，导致出现射精疼痛、勃起障碍等症状。建议患者需要及时就医，在医生指导下使用阿莫西林、头孢呋辛酯等药物进行抗感染治疗。
建议患者在日常生活中需要注意保持局部卫生清洁，每天勤换内裤，以免引起感染的情况。另外，患者还需要注意多休息，避免过度劳累，以免影响病情恢复。