巧克力囊肿3厘米一般需要手术，大约需要5000元到10000元，具体的价格还要根据患者选择的医院和当地的收费标准来决定。
巧克力囊肿是异位子宫内膜在卵巢内生长形成的囊肿，是一种常见的妇科疾病，发病率比较高，可能是由于子宫内膜异位症、子宫腺肌病等原因导致，患者会出现痛经、月经失调、性交痛、急腹痛等症状。巧克力囊肿治疗的时候可以使用腹腔镜手术，如果患者的症状比较轻，大概需要5000元左右，如果患者的症状比较严重，大概需要10000元左右。另外还可使用保守治疗，如在医生指导下使用甲地孕酮、达那唑、亮丙瑞林等药物，但保守治疗只能缓解症状，不能根治。
建议患者治疗期间需要注意休息，保持充足的睡眠，避免过度劳累，以免影响身体恢复。另外还要注意个人饮食，可以多吃一些含蛋白质高的食物，如牛奶、鸡蛋等。
