细菌学形态学检查中最常用的方法是革兰染色法。
革兰染色法是一种用于鉴定和分类细菌的染色方法，其原理是在显微镜下观察细菌细胞壁的结构。该方法使用革兰氏染料对细菌进行染色，使细菌细胞壁呈现不同的颜色反应。根据细菌细胞壁的颜色变化，可以确定细菌属于哪一类菌属或菌种，并进一步了解细菌的生物学特征、生长条件等信息。
革兰染色法广泛应用于临床微生物学实验室中，可用于检测各种感染性疾病，如肺炎链球菌性肺炎、脑膜炎奈瑟菌性脑膜炎等。此外，在食品工业、制药业等领域也有着重要的应用价值。
需要注意的是，革兰染色法仅能判断细菌的基本形态，无法提供更详细的细菌学信息。因此，在实际工作中需要结合其他细菌学检验方法，如培养试验、生化试验等，以全面评估细菌的种类和特性。