男女染色体不合，可以通过一般治疗、药物治疗、手术治疗、心理治疗、物理治疗等方式进行处理，以免加重病情。
1、一般治疗
如果夫妻双方或一方存在染色体异常的情况，但是并没有出现明显的不适症状，一般是不需要进行任何治疗的，所以不必过分担心。但是在怀孕期间要定期去医院进行产检，及时关注胎儿的生长发育情况。
2、药物治疗
如果存在染色体异常的情况，可能会影响到胎儿的正常发育，此时可以遵医嘱配合使用地屈孕酮片、黄体酮软胶囊等药物进行治疗，从而达到改善疾病的效果。
3、手术治疗
如果病情比较严重，通过上述治疗无法得到改善，还可以通过手术终止妊娠的方式进行处理，术后也要注意平时的护理，尽量多卧床休息。
4、心理治疗
染色体异常可能是在怀孕期间频繁接触化学物质所造成的，此时可以通过心理暗示疗法的方式进行处理，也可以通过心理疏导的方式进行改善。
5、物理治疗
如果患者存在染色体异常的情况，可能会出现肢体发育畸形的情况，甚至还会伴有智力低下的现象。此时可以通过康复训练的方式进行处理，也可以通过按摩的方式进行改善。
如果患者出现其他不适症状，建议及时前往医院就医治疗。