无痛肠镜检查一般需要一千多块钱，但地区、医院级别不同，价格也有一定差别。一般情况下，三级医院无痛肠镜检查费用在3000-5000元，如果需要做无痛肠镜下切除息肉、黏膜下切除、内镜下黏膜剥离术(EsD)等特殊手术，需要额外增加一千多块钱。无痛肠镜的主要作用是提高肠镜下疾病确诊率，但并不是所有的肠道疾病都适合无痛肠镜检查，有些疾病并不能通过肠镜检查发现，如肠息肉早期、炎症性肠病、肠癌等，所以需要结合其他检查进一步明确。
1、肠息肉早期：肠道息肉比较小或者息肉在肠镜下可以直接处理，此时不需要住院，可以避免肠镜下息肉出血或者破溃，住院1-2天就可以出院;
2、炎症性肠病：通过肠镜可以发现肠道炎症，如溃疡性结肠炎、克罗恩病等，可以通过肠镜下部分息肉切除，送病理检查进一步明确诊断，无痛肠镜下切除费用较高，一般需要5000-6000元;
3、肠癌：对于比较严重的肠癌，通过无痛肠镜基本可以确诊，但有时还需要完善腹盆CT和肠镜下病理活检，进一步明确肠癌的分期。后续需要通过手术切除整个肠道，这时也需要住院治疗，总体费用大概需要10000元，所以总费用需要30000-40000元。
此外，如果是麻醉状态下做无痛肠镜检查，还有肠镜下息肉切除、无痛肠镜下黏膜剥离术(EsD)，也是比较常用的手术方式。但因为麻醉要求，所以总费用加起来需要50000-60000元。
