男性生殖根部小疙瘩一碰就疼可能是毛囊炎、尖锐湿疣、龟头炎、珍珠状阴茎丘疹、皮脂腺异位症等原因引起的。
1.毛囊炎：如果患者平时不注意个人卫生，可能会导致细菌感染，从而诱发毛囊炎，在炎症的刺激下，会导致局部出现红色丘疹，并且会伴有疼痛的症状。建议患者可以在医生指导下使用红霉素软膏、夫西地酸乳膏等药物进行治疗。
2.尖锐湿疣：尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒感染引起的以肛门、生殖器部位增生性损害为主要表现的性传播疾病。一般表现为皮肤黏膜赘生物，可发生在男性的包皮系带、冠状沟、尿道口等处。如果不及时治疗，可能会导致病情加重，引起上述症状。建议患者可以遵医嘱通过激光、冷冻等方式进行物理治疗。
3.龟头炎：龟头炎是指龟头部由外伤、刺激或感染等因素引起的炎症。主要表现为龟头水肿、红斑、糜烂等症状，严重时还会伴随有瘙痒、刺痛感等情况。如果是细菌感染引起的，患者可在医生指导下涂抹莫匹罗星软膏、红霉素软膏等抗生素药膏进行抗感染治疗；对于真菌感染者，则需要遵医嘱服用氟康唑片、伊曲康唑胶囊等抗真菌药物来改善不适症状。
4.珍珠状阴茎丘疹：珍珠状阴茎丘疹是一种良性病变，可能与生理发育异常有关，通常好发于阴茎冠状边缘以及冠状沟的部位，会在局部形成淡白色、半透明的小丘疹，呈圆形或者是椭圆形，质地比较光滑，而且大小是均匀一致的。如果没有其他不适症状，一般不需要特殊处理，必要时也可以采取激光、液氮冷冻等方式进行治疗。
5.皮脂腺异位症：皮脂腺异位症是一种常见的皮肤病，主要是由于皮脂腺导管阻塞所造成的，会导致局部出现针头大小的扁平角质丘疹，呈正常肤色或者淡黄色，多见于阴茎、腹股沟等部位。一般不需要特殊治疗，如果影响美观，可以通过二氧化碳激光的方式进行治疗。
在日常生活中，建议患者要注意保持个人卫生，勤换内裤，避免发生不洁的性生活。饮食上尽量以清淡易消化、营养均衡为主，避免进食辛辣、油腻、生冷等刺激性食物。若患者不适症状加重或是出现新症状，还需及时就医诊治，以免延误病情。
