复方木香小檗碱片和黄连素是两种不同的药物，它们的主要区别在于成分组成、药理作用以及适应症等方面。
1. 成分组成：复方木香小檗碱片主要成分为木香、小檗碱等。而黄连素的通用名为盐酸小檗碱，其主要成分为该物质。
2. 药理作用：复方木香小檗碱片主要用于治疗胃肠道感染引起的腹泻、腹痛等症状，并具有抗菌作用。而黄连素则常用于治疗细菌性痢疾、肠炎等疾病，也有一定的抗病毒作用。
3. 适应症：由于复方木香小檗碱片主要针对胃肠道感染相关症状进行治疗，因此它的适应症较为局限。而黄连素因其广泛的应用范围，适用于多种不同类型的感染性疾病。
4. 剂型特点：复方木香小檗碱片为口服用药，需要通过口服的方式进行使用；而黄连素可以以片剂、胶囊等多种形式给药。
5. 化学结构：尽管这两种药物都属于抗生素类药物，但它们的化学结构有所不同。复方木香小檗碱片中的主要活性成分是小檗碱，它是一种天然存在于植物中的化合物；而黄连素则是人工合成的化学药物。
综上所述，复方木香小檗碱片和黄连素在成分组成、药理作用、适应症、剂型特点及化学结构方面存在差异。患者在选择用药时应遵循医生的建议并严格按照药品说明书上的用法用量来使用。
