清胃黄连丸区别于其他药物的主要成分不同、功效作用不同。该药的不良反应尚不明确。
1.主要成分类似：清胃黄连丸是由黄连、栀子(姜制)、石膏、牡丹皮、玄参等中药材组合而成的一种中成药制剂，具有清胃泻火、解毒消肿的功效，在临床上主要用于治疗足阳明胃经上焦实热所致的面赤口臭、牙龈肿痛、大便秘结以及消化性溃疡见上述证候者。而牛黄清胃丸也是由人工牛黄、菊花、麦冬、薄荷脑、石膏等多种药材制作而成的一种中成药，其也具有同样的功效与作用，可以用于治疗心脾积热、胃火炽盛所引起的头晕目眩、暴发火眼、牙齿疼痛、牙龈出血等症状。
2.功效作用不同：虽然两种药物都具有清胃泻火的功效，但是由于药物组成成分的不同，所以具体的作用也会有所差异。患者需要在医生的指导下用药。
3.不良反应：目前尚未发现清胃黄连丸出现明显的不良反应。如果患者长期服用或者大量服用牛黄清胃丸后出现了腹胀、腹泻、恶心呕吐等情况，则应该及时停药并去医院就诊。
建议患者在使用清胃黄连丸期间注意清淡饮食，避免食用辛辣刺激的食物，如辣椒、大蒜、芥末等，以免影响药效。若服药三天后症状无缓解，应及时去医院就诊。
