通常情况下，肠道菌群失调没有吃什么中成药最好的说法。肠道菌群失调的患者可以遵医嘱服用参苓白术散、四神丸、人参健脾丸、补脾益肠丸、肠炎宁颗粒等药物进行治疗。
1、参苓白术散
参苓白术散主要是由人参、茯苓、白术等中药组成，具有补脾胃、益肺气的功效，在临床上常用于治疗脾胃虚弱、食少便溏等症状，也可以用于改善肠道菌群失调的情况。但对于感冒发热、咳嗽痰多、腹胀、腹痛等患者不宜服用。
2、四神丸
四神丸主要是由肉豆蔻、补骨脂、五味子等中药组成，具有温肾散寒、涩肠止泻的功效，在临床上常用于治疗肾阳不足所致的泄泻，症见肠鸣腹胀、五更溏泄、食少不化、久泻不止、面黄肢冷等。但对于腹痛、腹胀、大便干结等患者不宜服用。
3、人参健脾丸
人参健脾丸主要是由人参、白术、茯苓等中药组成，具有健脾益气、和胃止泻的功效，在临床上常用于治疗脾胃虚弱所致的饮食不化、恶心呕吐、腹痛便溏等症状，也可以用于改善肠道菌群失调的情况。但对于腹泻、呕吐、腹胀等患者不宜服用。
4、补脾益肠丸
补脾益肠丸主要是由黄芪、党参、砂仁等中药组成，具有补中益气、健脾和胃、涩肠止泻的功效，在临床上常用于治疗脾虚泄泻症，症见腹泻腹痛、腹胀、肠鸣等。感冒发热、咳嗽痰多、脘腹胀满等患者不宜服用。
5、肠炎宁颗粒
肠炎宁颗粒主要是由地锦草、黄毛耳草等中药组成，具有清热利湿的功效，在临床上常用于治疗急慢性胃肠炎、腹泻、细菌性痢疾等疾病。但对于高血压、心脏病、肝病等慢性病严重者应在医师指导下服用。
建议患者在医生指导下使用上述药物，避免自行用药，以免引起不良反应，导致病情加重。日常生活中应注意饮食卫生，避免食用生冷食物，同时注意休息，避免过度劳累。
