季铵盐消毒液具有广谱杀菌作用，可以用于物体表面、皮肤黏膜的消毒。临床上常用的有碘伏、双氧水等。
1.物体表面：一般使用浓度为0.2%-0.5%的溶液进行擦拭物体表面，可起到较好的消毒效果。如果需要对医疗器械进行浸泡，则建议使用4%的溶液进行处理，能够有效杀死细菌。
2.皮肤黏膜：由于其刺激性较小，因此患者也可遵医嘱用棉签蘸取适量的液体涂抹于患处，但不建议经常使用，以免导致局部出现不适症状。
除此之外，还可以应用于手术前手部和器械的消毒以及肠道灭菌等方面。但由于该药物属于外用制剂，不可内服，否则可能会引起腹痛、腹泻等症状。若在用药期间出现了其他明显不适，还需及时就医诊治，以免延误病情。
