灰指甲一般指甲癣，抹上抑菌液会疼痛可能是药物刺激、过敏反应、甲沟炎、甲癣本身导致的，患者需要根据具体的原因进行相应的治疗。
1、药物刺激
抑菌液是一种外用药物，主要成分是苯甲酸和水杨酸等，具有抗真菌的作用，可以用于治疗手癣、足癣、体癣等疾病。由于药物中的成分具有一定的刺激性，涂抹在指甲部位后可能会对局部皮肤造成刺激，从而出现疼痛的情况。这是正常的现象，患者不需要过分担心，也不用进行特殊治疗。
2、过敏反应
如果患者属于过敏体质，可能会对抑菌液中的某些成分过敏，从而引起过敏反应，出现局部红肿、瘙痒、疼痛等症状。建议患者立即停止使用该药物，可以用清水清洗掉涂抹的药物。同时，患者也可以在医生的指导下服用氯雷他定片、盐酸西替利嗪片等抗过敏的药物进行治疗。
3、甲沟炎
甲沟炎是指甲周围软组织的急性炎症，通常与细菌感染有关。临床上一般会表现为局部发红、肿胀、疼痛等症状。建议患者可以在医生指导下使用夫西地酸乳膏、复方多粘菌素B软膏等涂抹患处进行治疗。
4、甲癣本身导致
甲癣是由皮癣菌侵犯甲板或甲下所引起的疾病，可能与手足癣直接传染有关。临床上一般会表现为指甲浑浊、增厚、变脆、变色等症状。由于存在一定的传染性，因此不建议与他人共用私人物品。另外，灰指甲的患者在使用抑菌液时也会出现疼痛的症状。因为灰指甲的患者本身就患有甲沟炎这种疾病，所以在使用抑菌液时就会刺激到局部的炎症，从而出现疼痛的症状。此时患者需要在医生的指导下口服抗生素类的药物治疗，比如阿莫西林胶囊、头孢克肟胶囊等。
5、其他原因
此外，还可能是外伤、末梢神经敏感等原因导致的。如果患者的症状比较严重，建议及时到正规医院就医并治疗。
