如果患者出现急性胃肠炎、细菌性痢疾等疾病时，可以在医生指导下服用黄连素进行治疗。但是如果是其他原因引起的腹痛、腹泻等症状，则不建议盲目使用此药物。
1.急性胃肠炎：通常是由于进食不洁食物或者感染轮状病毒等原因所导致，可能会引起恶心呕吐、腹部胀气以及腹泻等症状。此时可以在医生的指导下服用黄连素片进行抗感染治疗，并且还要注意多喝一些温开水补充水分，以免因大量腹泻而发生脱水的情况。
2.细菌性痢疾：是由于摄入被痢疾杆菌污染的食物和水源所致的一种肠道传染病，容易使患者出现大便次数增多、排黏液脓血便等症状。此时可遵医嘱应用黄连素片进行治疗，能够起到抗菌消炎的作用，从而促进病情恢复。
3.阿米巴肠病：主要是由阿米巴原虫寄生在结肠内引起，会导致患者出现腹痛、腹泻、排腥臭味粪便等症状。若明确诊断为该病后，可在医生指导下服用黄连素片进行治疗，因为其具有较强的抑菌作用，可以帮助改善不适症状。
4.霍乱弧菌肠炎：通常与食用了含有霍乱弧菌的食物有关，会引起严重的腹泻、呕吐及脱水现象。对于轻度腹泻者，一般不需要特殊处理，适当休息即可。而对于重度腹泻者，则需要及时就医，在医生指导下使用黄连素片、诺氟沙星胶囊等药物进行治疗。
5.伪膜性肠炎：可能与长期滥用抗生素类药物有关，容易诱发假膜性结肠炎，会对身体健康造成影响。一旦确诊，需要立即停用所有正在使用的抗生素，同时联合遵医嘱口服蒙脱石散、双歧杆菌三联活菌散等止泻剂、益生菌制剂进行对症支持治疗。
需要注意的是，若是出现了胃溃疡、十二指肠溃疡等疾病，单纯地服用黄连素并不能达到较好的效果，还需要遵医嘱配合使用奥美拉唑肠溶胶囊、雷贝拉唑钠肠溶片等药物共同治疗。
