功能性胃肠疾病患者可以在医生的指导下服用调节肠道菌群类药物、促进胃动力的药物、调节神经功能的药物、抗焦虑抑郁药物、解痉止痛药物等，一般治疗效果较好。
1、调节肠道菌群类药物
功能性胃肠疾病是指由于胃肠道功能紊乱引起的一系列症状，患者可以在医生的指导下服用调节肠道菌群类药物，比如乳酸菌素片、双歧杆菌三联活菌胶囊等，可以改善肠道菌群失调的情况，从而缓解不适症状。
2、促进胃动力的药物
如果患者出现腹胀、腹痛等症状，可以在医生的指导下服用促进胃动力的药物，比如多潘立酮片、枸橼酸莫沙必利片等，可以促进胃肠道蠕动，有利于症状的改善。
3、调节神经功能的药物
功能性胃肠疾病可能会导致患者出现腹胀、腹痛等症状，还可能会引起焦虑、抑郁等精神症状，患者可以在医生的指导下服用调节神经功能的药物，比如谷维素片、维生素B1片等，有利于缓解精神压力，保持良好的心态。
4、抗焦虑抑郁药物
如果患者出现了明显的焦虑、抑郁等情绪，可以在医生的指导下服用抗焦虑抑郁的药物，比如盐酸舍曲林片、盐酸帕罗西汀片等，能够起到缓解情绪的目的。
5、解痉止痛药物
如果患者出现了腹痛的症状，可以在医生的指导下服用解痉止痛类药物，比如颠茄片、消旋山莨菪碱片等，能够起到缓解疼痛的目的。
在日常生活中，患者要注意饮食健康，尽量吃清淡类食物，但是避免吃辣椒等辛辣刺激性食物，也不可以吃生冷寒凉类食物。如果患者出现不适症状，建议及时就医治疗。
