桥本甲状腺炎和亚甲炎的主要区别是发病原因和症状不同。亚急性甲状腺炎是由病毒感染所致 ,可能会有发热、甲状腺部位疼痛等表现,需要在医生的指导下服用抗生素或抗病毒的药物。桥本甲状腺炎是一种自身免疫疾病,初期一般不会有什么特别的表现,但是会随着时间的推移而发生甲状腺肿大。