膀胱镜与输尿管镜的区别是检查的部位和深度不同等。膀胱镜和输尿管镜都属于微创内镜,不仅是一种检查方法,也是一种治疗手段。不同的是膀胱镜主要用于检查膀胱和尿道的病变,同时治疗膀胱和尿道的病变。输尿管镜又细又长不仅可以检查尿道和膀胱,还可以深入输尿管检查输尿管的病变,治疗输尿管病变。