六味地黄丸明目地黄丸和杞菊地黄丸的区别是药物组方、功效不同不同。明目地黄丸和杞菊地黄丸是在六味地黄丸基础上,对药方进行加减形成新的中药成方。杞菊地黄丸是在六味地黄丸基础上增加了枸杞子和菊花,明目地黄丸是在杞菊地黄丸基础上增加了石决明、蒺藜、磁石。明目地黄丸具有滋肾养肝、明目之功效,杞菊地黄丸具有滋肾养肝作用,用于肝肾亏虚引起的眩晕、耳鸣、迎风流泪、羞明畏光、视物昏花等。