怀孕后期患有阴道炎可以使用复方甲硝唑栓。复方甲硝唑栓属于外用药,主要成分为甲硝唑和奥硝唑,能够抑制厌氧菌生长,从而起到抗菌作用,对于细菌性阴道炎有较好的治疗效果。如果孕妇对甲硝唑或奥硝唑过敏,则不能使用复方甲硝唑栓。在孕期出现阴道炎症状时,应咨询医生建议,在专业指导下使用药物以确保母婴健康。