宫外孕手术后三个月小腹阵痛可能由术后并发症、残留病灶引起。宫外孕术后三个月的小腹阵痛可能与术后并发症如输卵管炎、粘连或残留病灶相关,这些因素可能导致慢性盆腔疼痛。此外,还应考虑是否有肠梗阻、肠道炎症等消化系统疾病的可能性,因为这些疾病也可能导致腹部不适。此时需要进一步排查以确定具体原因。在关注腹痛的同时,应注意观察阴道出血情况,以及有无发热等症状。若症状持续不缓解或加重,应及时就医复查。