三个月大的婴儿厌食，可能是由于生理性因素引起的，也可能是由于消化不良、缺乏微量元素、胃肠道菌群失调症、急性胃肠炎等病理性因素引起的，建议家长根据婴儿自身的具体情况选择合适的治疗方式。
1、生理性因素
如果婴儿的喂养方式不当，导致婴儿吃奶过少，或者是吃奶时不专心，可能会导致婴儿吃奶时注意力不集中，出现厌食的症状。建议家长采用合适的喂养方式，注意婴儿吃奶时的姿势，以免导致婴儿吃奶时注意力不集中。
2、消化不良
如果婴儿一次性吃太多奶，可能会导致食物在胃肠道内堆积，无法及时消化和吸收，引起消化不良，出现厌食、腹胀、腹痛等症状。家长可以通过腹部按摩的方式，促进婴儿胃肠道蠕动，有助于缓解症状。必要时，家长也可以在医生指导下给婴儿服用乳酸菌素片、枯草杆菌二联活菌颗粒等药物进行治疗。
3、缺乏微量元素
如果婴儿体内缺乏微量元素，可能会导致味觉减退，出现厌食的症状，还可能会伴有皮肤干燥、头发干枯等症状。家长可以在医生指导下给婴儿服用葡萄糖酸锌口服溶液、赖氨葡锌颗粒等药物进行治疗。
4、胃肠道菌群失调症
如果婴儿的胃肠道菌群失调，可能会导致胃肠道蠕动减慢，食物无法及时消化和吸收，引起厌食的症状，还可能会伴有腹胀、腹痛等症状。家长可以在医生指导下给婴儿服用双歧杆菌三联活菌散、枯草杆菌二联活菌颗粒等药物进行治疗。
5、急性胃肠炎
如果婴儿吃了不干净的食物，可能会导致细菌感染胃肠道，引起急性胃肠炎，可能会出现厌食、恶心、呕吐等症状。家长可以遵医嘱给婴儿服用阿莫西林颗粒、头孢克肟颗粒等药物进行治疗。
在日常生活中，家长要注意婴儿的护理，注意保暖，避免着凉，保持室内空气清新，多开窗通风。建议家长及时带婴儿就医，明确具体病因后进行对症治疗。
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