右侧肩胛骨下方深呼吸疼痛有以下几方面原因:第一,局部出现了损伤 。由于损伤的存在,在深呼吸时局部的肌肉、筋膜、韧带受到牵拉,从而导致损伤加重,造成疼痛症状。第二,局部的无菌性炎症导致的。比如急性损伤以后恢复不良、慢性劳损、局部的受凉受潮等原因产生无菌性炎症。第三,有可能是涉及到肺部疾病,比如胸膜炎、肺感染等。