头孢曲松钠和头孢哌酮钠都属于第三代头孢菌素类抗生素，具有抗菌谱广、抗菌活性强、对β-内酰胺酶较稳定及对肾脏毒性小等优点。但在药物代谢、药物副作用、应用方面有所区别。
1、药物代谢
头孢曲松钠属于第三代头孢菌素类抗生素，其主要通过抑制细菌细胞壁的合成，使细菌的细胞壁缺损，从而导致细菌的溶解和死亡，起到抗菌的作用。而头孢哌酮钠属于第二代头孢菌素类抗生素，其主要通过抑制细菌细胞壁的合成，使细菌的细胞壁缺损，从而起到抗菌的作用。
2、药物副作用
头孢曲松钠的副作用主要包括过敏、胃肠道反应、血液系统反应、肝肾功能损伤等。而头孢哌酮钠的副作用主要包括恶心、呕吐、腹泻、皮疹、瘙痒等。
3、应用
头孢曲松钠主要用于治疗敏感菌引起的感染性疾病，如呼吸道感染、泌尿系统感染、皮肤软组织感染、急性胆道感染等。而头孢哌酮钠主要用于治疗敏感菌引起的各种感染性疾病，如上呼吸道感染、下呼吸道感染、尿路感染、败血症、腹膜炎、手术后感染等。
需要注意的是，上述药物都需要在医生的指导下合理用药，避免盲目用药，以免引起严重的药物不良反应，损害身体健康。如果用药后出现不适症状，建议患者及时就医治疗。
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