丙基硫氧嘧啶与甲巯咪唑相比，一般丙基硫氧嘧啶的副作用会比较小一些。
丙基硫氧嘧啶是一种硫脲类的抗甲状腺药物，可以抑制甲状腺内过氧化物酶，从而阻碍甲状腺素、三碘甲状腺原氨酸合成，从而达到治疗甲状腺功能亢进症的效果。而甲巯咪唑是一种咪唑类的抗甲状腺药物，可以抑制甲状腺内过氧化物酶，从而阻碍甲状腺素、三碘甲状腺原氨酸合成，从而达到治疗甲状腺功能亢进症的效果。由于丙基硫氧嘧啶的副作用较小，所以丙基硫氧嘧啶的副作用会比较小一些。但患者也需要在医生的指导下服用，避免自行服用，以免出现不适症状。如果患者对丙基硫氧嘧啶过敏，则不建议服用，以免出现过敏反应，例如皮肤瘙痒、红肿等。另外，如果患者服用药物后出现恶心、呕吐等不良反应，需要及时停药，并到医院进行检查，必要时需要进行治疗。
此外，建议患者在服用丙基硫氧嘧啶期间，需要注意避免食用辛辣刺激性食物，例如辣椒、花椒或者是芥末等，以免影响药物效果，还可能会导致病情加重。同时患者在服用丙基硫氧嘧啶时，需要注意监测血常规，还需在医生的指导下服用，以免出现白细胞减少、粒细胞缺乏症等副作用。
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