新生儿肛门囊肿做完手术一般需要1-3周的时间才能恢复，具体的时间要根据新生儿的病情严重程度、个人体质、术后护理等因素来决定。
新生儿肛门囊肿一般是由于先天性发育异常、局部炎症刺激等原因所引起的，通常会出现肛门部位红肿、疼痛等症状，如果新生儿病情比较轻，囊肿比较小，而且个人体质比较好，术后护理得当，一般1周左右的时间就能恢复。如果新生儿病情比较严重，囊肿比较大，而且个人体质比较差，术后护理不当，导致局部出现感染的情况，则恢复的时间会相对延长，一般需要3周左右的时间才能恢复。
新生儿出现肛门囊肿的情况，家长要及时带新生儿去正规医院就诊，并在医生的指导下进行规范的治疗，以免延误病情，给身体带来不良的影响。在日常生活中，建议家长要注意新生儿的个人卫生，勤换洗内裤，并放在太阳下暴晒，能够起到消毒杀菌的作用。
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