儿童生长障碍的原因多样，包括内分泌疾病、全身性疾病、骨骼系统及遗传代谢性疾病、精神因素和医源性因素。
内分泌疾病如生长激素缺乏、甲状腺功能低下、性激素不足以及肾上腺皮质功能障碍。全身性疾病如寄生虫感染、感染性疾病、吸收不良综合征、先天性心脏病、食物过敏、幽门狭窄、胃肠道畸形、免疫缺陷病和恶性肿瘤等。骨骼系统及遗传代谢性疾病涵盖维生素D缺乏引起的佝偻病、肾性佝偻病、抗维生素D佝偻病、范可尼综合征、肾小管酸中毒、维生素D依赖性佝偻病和软骨发育不良等。精神因素，特别是抑郁，可能抑制生长。医源性因素如长期使用激素治疗也可能影响生长。
内分泌疾病如生长激素缺乏、甲状腺功能低下、性激素不足以及肾上腺皮质功能障碍。全身性疾病如寄生虫感染、感染性疾病、吸收不良综合征、先天性心脏病、食物过敏、幽门狭窄、胃肠道畸形、免疫缺陷病和恶性肿瘤等。骨骼系统及遗传代谢性疾病涵盖维生素D缺乏引起的佝偻病、肾性佝偻病、抗维生素D佝偻病、范可尼综合征、肾小管酸中毒、维生素D依赖性佝偻病和软骨发育不良等。精神因素，特别是抑郁，可能抑制生长。医源性因素如长期使用激素治疗也可能影响生长。
