新生儿先天性胃穿孔的原因包括胃壁肌层发育不良、胃壁缺血性坏死、感染等 。胃壁肌层发育缺陷是主要原因,胃壁肌层发生障碍导致胃壁肌层缺损,喂奶或呕吐时胃内压升高,导致肌层缺损处黏膜破裂、穿孔。胃壁缺血性坏死与患儿有明显窒息史有关,缺氧状态下,胃肠血供相对减少,出现缺血、坏死、穿孔。新生儿局部免疫力低下、胃壁屏障机能不完善,胃肠道内菌群过繁殖产生胃炎出现穿孔。