小孩的生殖器官疼可能是生理性因素引起的，但也可能是由于包皮过长、尿路感染等原因引起的。
1、生理性因素
生理性因素主要包括寒冷、紧张、性兴奋等，容易导致交感神经兴奋，从而引起生殖器官出现疼痛，一般属于正常的生理现象，不需要特殊治疗。家长应给小孩适当增添衣物，注意保暖，可有效缓解症状。
2、包皮过长
包皮过长是指男性阴茎包皮完全覆盖阴茎头及尿道外口，可能会导致生殖器官疼痛，还可能伴有尿频、尿急、排尿困难等症状。如果是因为包皮过长引起的生殖器官疼痛，可进行包皮环切术治疗。
3、尿路感染
尿路感染是指病原体在尿路中异常繁殖所致的感染性疾病，小孩可能会出现生殖器官疼痛，还可能会伴有尿频、尿急、血尿等症状。可在医生指导下口服头孢克肟、阿莫西林等抗生素药物进行治疗。平时应注意多喝水，多排尿，有利于疾病恢复。
除以上常见因素外，还可能是由于阴茎炎、盆腔炎、睾丸炎等引起的，应及时到医院完善相关检查，明确原因，再进行针对性治疗。
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