非典型性肺炎飞沫是否会通过眼睛传播，需要根据具体的情况进行综合考虑。
1、可能不会通过眼睛传播
如果非典型性肺炎的传染力比较弱，而且患者正处于疾病的潜伏期，此时接触了患者的飞沫以后，一般不会出现感染的情况。但是要定期去医院进行复查，及时关注身体的变化。
2、可能会通过眼睛传播
如果患者正处于疾病的急性期，而且自身的免疫力比较低，此时接触了患者的飞沫以后，可能会增加交叉感染的概率，从而诱发眼睛部位感染的情况。如果患者感染了肺炎，需要在医生的指导下，配合使用罗红霉素胶囊、抗病毒口服液等药物进行治疗。
在日常生活中，需要注意平时的护理工作，不建议他人共用私人物品，也要避免频繁去公共场所，否则会增加交叉感染的概率。另外，需要适当进行体育锻炼，比如打羽毛球、练习瑜伽等，从而促进体内的血液循环，也可以增强自身的免疫力。
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