乙脑疫苗一般是指乙型脑炎疫苗，发烧一般是指发热。打完乙型脑炎疫苗发热39°C，可能是上呼吸道感染导致的，也可能是过敏、急性支气管炎等原因导致的，患者应及时去医院就诊，明确病因，对症治疗。
1、上呼吸道感染
乙型脑炎疫苗是一种预防乙型脑炎病毒感染的疫苗，在注射后会刺激机体免疫系统产生免疫反应，从而出现发热的症状。如果体温没有超过38.5°C，可以通过物理降温的方式进行缓解，可以使用温毛巾擦拭身体，也可以在医生的指导下服用对乙酰氨基酚片、布洛芬缓释胶囊等药物治疗。
2、过敏
如果患者对乙型脑炎疫苗中的成分过敏，可能会出现过敏反应，从而出现发热的症状。如果体温没有超过38.5°C，可以通过冰袋冰敷、温水擦浴等方式进行物理降温。如果体温超过38.5°C，可以遵医嘱服用氯雷他定片、盐酸西替利嗪片等药物治疗。
3、急性支气管炎
如果患者在打完乙型脑炎疫苗之后，受到细菌或病毒的感染，可能会引起急性支气管炎，从而出现发热的症状。如果体温没有超过38.5°C，可以多喝温水，促进新陈代谢，有利于病情的恢复。如果体温超过38.5°C，可以遵医嘱服用阿莫西林胶囊、头孢克肟颗粒等药物进行治疗。
除此之外，也可能是肺炎、脑炎、脑膜炎等原因导致的，建议患者应及时去医院就诊，明确病因，对症治疗。
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