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磷酸氟达拉滨的说明书中有以下不良反应:
本品可引起严重不良反应。约59%病人出现与剂量有关的骨髓抑制,包括贫血、血小板减少、中性白细胞减少和CD4+细胞缺乏。该不良反应是可以逆转的,应定期测定外周血细胞数以防造血系统不良反应。其它不良反应有轻至中度的恶心和呕吐(36%)、发热(60%),疼痛(20%)、感染(33%)、寒战、腹泻,厌食、不适、药疹、水肿、咳嗽、胰腺炎等。有时还会出现肿瘤溶解综合征。可表现为胸痛、血尿、高尿酸血症、高磷酸盐血症,低血钙、高血钾、尿酸盐结晶尿症、肾衰,可发生于治疗的第一周,对那些有危险病人应采取预防措施