先天性耳瘘发炎流脓可以通过局部用药、口服药物、手术治疗等方式进行治疗，需要根据病情的严重程度，采取对应的治疗方式。
1、局部用药
先天性耳瘘发炎流脓可能是不注意局部的清洁与卫生，导致细菌感染所引起的，可能会出现局部肿胀、疼痛、发热等症状。可以在医生的指导下使用医用碘伏、医用酒精等药物进行消毒处理，也可以遵医嘱使用复方多粘菌素B软膏、莫匹罗星软膏等药物进行治疗。
2、口服药物
如果病情比较严重，需要及时遵医嘱服用抗生素类的药物进行治疗，比如阿莫西林胶囊、头孢克肟胶囊等，同时还可以配合服用盐酸左氧氟沙星胶囊、阿奇霉素胶囊等药物进行辅助治疗。
3、手术治疗
如果病情比较严重，通过上述治疗无法得到改善，则需要及时到正规医院，通过手术切开排脓的方式进行治疗。术后还要注意局部的清洁与卫生，尽量避免用手挠抓。
除此之外，先天性耳瘘发炎流脓还可以通过日常调理、红外线理疗等方式进行改善。日常生活中，还要注意个人卫生，保持局部清洁干燥。同时还要注意作息规律，避免过度劳累。
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