发烧一般指发热，拉肚子一般指腹泻，连续发热39°C第三天开始腹泻可能是由于急性胃肠炎、上呼吸道感染、肺炎等原因引起的，建议患者根据不同的原因采取相应的治疗措施。
1、急性胃肠炎
急性胃肠炎主要是由于感染、饮食不洁等因素引起的胃肠黏膜急性炎症性损伤，患者一般会出现发热、腹泻、腹痛等症状。由于炎症刺激，患者可能会出现持续发热的情况。建议患者可以在医生指导下使用阿莫西林、头孢曲松钠等进行抗感染治疗。同时，患者还可以遵医嘱服用布洛芬、对乙酰氨基酚等非甾体类抗炎药进行治疗。
2、上呼吸道感染
上呼吸道感染主要是由于流感病毒、腺病毒等感染引起的上呼吸道炎症性疾病。由于炎症刺激，患者会出现发热、头痛、腹泻等症状，部分患者可能会表现为持续发热39°C的情况。建议患者可以在医生指导下使用奥司他韦、利巴韦林等进行抗病毒治疗。同时，患者也可以适当饮用温水，改善腹泻的症状。
3、肺炎
肺炎主要是由于细菌感染、免疫损害等因素引起的肺部炎症性病变。由于炎症刺激，患者会出现发热、咳嗽、咳痰等症状，部分患者可能会表现为持续发热39°C的情况。建议患者可以在医生指导下使用阿莫西林、头孢呋辛酯等药物进行抗感染治疗。同时，患者也可以遵医嘱使用阿昔洛韦、更昔洛韦等药物进行抗病毒治疗。
除此之外，腹泻、急性胃肠炎等疾病也可能会引起发热39°C的情况，建议患者及时就医，根据不同的病因对症治疗，以免延误病情。
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