怀孕两周了一般不建议进行药物流产打掉孩子最安全，可以选择人工流产手术。
怀孕两周时，如果不想保留孩子，可以选择药物流产，药物流产适用于停经49天以内的宫内妊娠。药物流产是通过药物的方式达到终止妊娠的目的，妊娠产物通过阴道排出体外，如果药物流产不完全，需要进行清宫手术。
如果药物流产不完全，需要进行清宫手术，清宫手术会对子宫内膜造成损伤，可能会导致宫腔粘连，严重时会影响以后的怀孕。所以怀孕两周了，如果不想保留孩子，可以选择人工流产手术。
患者可以及时去医院进行相关检查，根据检查的结果，在医生的指导下选择合适的方式来终止妊娠。
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