阴茎流脓、小便疼痛可能是尿道炎、急性细菌性前列腺炎、淋病、淋菌性尿道炎、非特异性尿道炎等原因导致的，患者需要根据病因选择合适的药物进行治疗。
1、尿道炎
如果患者存在尿道炎，可能会使尿道黏膜受到细菌感染，从而出现尿频、尿急等症状，随着病情发展，可能会出现阴茎流脓的情况。患者可以遵医嘱服用抗生素类药物进行治疗，比如阿莫西林胶囊、头孢拉定胶囊等。
2、急性细菌性前列腺炎
如果患者存在急性细菌性前列腺炎，可能会使前列腺部位受到细菌感染，从而出现尿频、尿急等症状，严重时还可能会出现阴茎流脓的情况。患者可以遵医嘱服用抗生素类药物进行治疗，比如阿莫西林胶囊、头孢拉定胶囊等，可以起到抗炎杀菌的作用。
3、淋病
淋病是由淋病奈瑟菌感染引起的一种性传播疾病，可能会出现阴茎红肿、阴茎疼痛等症状，还可能会出现尿道口红肿的情况。患者可以遵医嘱使用注射用头孢曲松钠、注射用盐酸大观霉素等药物进行治疗，可以起到抗感染的作用。
4、淋菌性尿道炎
如果患者存在淋菌性尿道炎，可能会使尿道口受到淋球菌感染，从而出现尿频、尿急等症状，随着病情发展，可能会出现阴茎流脓的情况。患者可以遵医嘱服用头孢克肟胶囊、盐酸左氧氟沙星胶囊等药物进行治疗，可以起到抗感染的作用。
5、非特异性尿道炎
非特异性尿道炎是指由淋球菌以外的其他病原体，主要是沙眼衣原体和支原体引起的一种性传播疾病，可能会出现阴茎头红肿、刺痒、尿频、尿痛等症状。患者可以在医生的指导下使用阿奇霉素片、盐酸多西环素胶囊等药物进行治疗。
在日常生活中，患者应注意个人卫生，勤换内裤，避免不洁性生活。如果患者症状持续或加重，建议及时就医治疗，以免延误病情。
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