月经结束两天同房射进去了有怀孕的可能性。月经结束后两天,女性体内可能仍存在一定量的未被完全排出的卵子,且子宫内膜开始修复,具备一定的受孕条件。因此,即使是在月经结束后的短时间内进行性行为并射精,仍然存在怀孕的风险。如果女性处于排卵期,则怀孕几率较高;若在非排卵期则怀孕概率较低。建议采取避孕措施以减少意外怀孕的风险,并监测身体变化,如有不适及时就医。