手术治疗目前分为保留生育功能手术,保留卵巢功能手术,根治性手术及辅助性手术.保留生育功能手术,适合于年轻有生育要求的患者,特别是采用药物治疗无效的.保留卵巢功能手术,主要适合于年龄45岁以下且无生育要求的重症患者或复发经保守手术或药物治疗无效,但希望保留卵巢内分泌功能者,腹腔镜是诊断和治疗的最好的办法,这是手术治疗;二,卵巢功能抑制或者叫抑制卵巢功能是最好的子宫内膜异位症的药物治疗如丹那唑,孕三烯酮,甲孕酮(安宫黄体酮)到现在的抑那通;第三,生育本身是子宫内膜异位症最好的生理治疗,已有孩子第三步不考虑了.