通常情况下，肛窦炎患者遵医嘱使用甲硝唑、头孢克洛、阿莫西林等抗生素类药物治疗比较好。
1、甲硝唑
甲硝唑是一种抗厌氧菌的抗生素，具有抗菌谱、抗原虫作用、致病力弱等特点。甲硝唑可以通过抑制细菌DNA的合成，使细菌死亡，对大多数厌氧菌具有良好的抗菌作用。因此，甲硝唑是治疗肛窦炎的首选药物。
2、头孢克洛
头孢克洛是第三代头孢菌素，抗菌谱比较广，对革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌均有较好的抗菌作用，可以通过抑制细菌细胞壁的合成，使细菌死亡，从而起到抗菌的作用。因此，头孢克洛也是治疗肛窦炎的首选药物。
3、阿莫西林
阿莫西林是一种广谱抗菌药，通过抑制细菌细胞壁合成而发挥抗菌的作用，可以通过抑制细菌细胞壁的合成，使细菌死亡，从而起到抗菌的作用。因此，阿莫西林也是治疗肛窦炎的首选药物。
除此之外，肛窦炎患者还可以遵医嘱使用左氧氟沙星、克拉霉素等药物进行治疗。建议患者在日常生活中，要注意饮食，不要吃辛辣刺激的食物，如辣椒、花椒等，以免加重病情。同时，要注意休息，避免熬夜，以免影响病情恢复。
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鼻渊通窍颗粒
疏风清热，宣肺通窍。用于急鼻渊（急性鼻窦炎）属外邪犯肺证，症见前额或颧骨部压痛，鼻塞时作，流涕黏白或黏黄，或头痛，或发热，苔薄黄或白，脉浮。
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本品为免役刺激剂（immunostimulant），适用于细胞免疫功能低下患者：1.呼吸道反复感染（气管炎、支气管炎）；2.耳鼻喉科反复感染（鼻炎、鼻窦炎、耳炎、咽炎、扁桃体炎）；3.泌尿系统反复感染；4.妇科反复感染；可用于预防感染性期病症，缩短病程，减轻疾病的严重度，减少反复发作次数，也可作为急性感染时抗菌药物治疗的辅助用药。
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