早上尿液呈现咖啡色通常是由于生理性因素引起的，但也可能是由于肾小球肾炎、尿路感染等病理性因素引起的。
1、生理性因素
若患者饮水较少，水分不足导致尿液浓缩，就可能会出现尿液呈现咖啡色的情况。此外，若患者食用了大量含有红色素的食物，比如红心火龙果等，也可能会导致早上尿液呈现咖啡色。这种情况通常属于正常的生理现象，一般不需要特殊治疗，患者可以多喝水，一般两天后尿液颜色会恢复正常。
2、肾小球肾炎
肾小球肾炎是指肾小球损伤而引起的疾病，可能与遗传、感染等因素有关。若患者患有肾小球肾炎，肾小球滤过功能下降，就可能会导致尿液中存在红细胞，从而出现尿液呈现咖啡色的情况。患者可以在医生指导下服用、氢等利尿剂药物进行治疗。必要时，患者还可以通过肾移植术进行治疗。
3、尿路感染
尿路感染是指病原体在尿路中异常繁殖所致的感染性疾病，可能与细菌感染、其他病原体感染等因素有关。若患者患有尿路感染，尿液中可能会出现大量白细胞，导致尿液呈现咖啡色。患者可以在医生指导下服用诺氟沙星、头孢克洛等抗生素药物进行治疗。
除上述相对常见的原因外，还有可能是由于肾结石、膀胱癌、输尿管癌等疾病引起的，建议患者及时就医，明确诊断后对症治疗。
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