宝宝得了手足口病已经第三天发复发高烧可能是病毒感染、细菌感染、支原体感染等原因引起的，需要根据实际情况进行针对性处理。
1、病毒感染
如果宝宝得了手足口病，病毒侵犯到体温调节中枢，可能会引起发热的症状。家长可以遵医嘱给宝宝服用抗病毒口服液、利巴韦林颗粒等药物进行治疗。
2、细菌感染
如果宝宝得了手足口病，并且合并细菌感染，可能会出现高热的症状。家长可以遵医嘱给宝宝服用阿莫西林胶囊、头孢克肟颗粒等药物进行治疗。
3、支原体感染
如果宝宝得了手足口病，并且合并支原体感染，可能会出现咳嗽、发热等症状。家长可以遵医嘱给宝宝服用阿奇霉素颗粒、罗红霉素颗粒等药物进行治疗。
此外，宝宝得了手足口病已经第三天发复发高烧也可能是病毒性心肌炎、肺炎等原因引起的，建议及时就医治疗。
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